Theo thông tin giới thiệu của ban quản lý di tích, đền Sinh cùng với đền Hóa gần đó đều gắn với truyền thuyết Đức Thánh Phi Bồng Hiệu Thiên ra đời. 

Đền Sinh thờ Đức Thánh Mẫu Thạch Bàn tối tú, tối linh. Đây là tượng đá tự nhiên mang dáng hình độc đáo. Đền Hóa thờ Đức Thánh Phi Hồng Hiệu Thiên. Ngài nguyên là một chòm sao Bắc Đẩu, phụng sắc chỉ của Ngọc Hoàng thượng đế giáng xuống trần gian để hộ quốc cứu dân. Đền Sinh được lập nơi Đức Thánh Mẫu Thạch Bàn hạ sinh Đức Thánh Phi Bồng Hiệu Thiên. Đền Hóa được lập nơi Đức Thánh Phi Bồng Hiệu Thiên thăng hóa về trời. Hai ngôi đền cách nhau chừng 800m nhưng cùng chung một không gian văn hóa tâm linh.

Được biết, bia Ngọc Phả Thiên Thần Vị có ghi: Tại đầu khu đất trang Chi Ngại, Yên Mô, huyện Phượng Nhãn, xứ Kinh Bắc có một khối đá vuông như chiếu lớn. Nơi đây địa thế sơn thủy hữu tình, linh chung thú khí. 

Bấy giờ, vào giờ Dần ngày 8/5, mặt trời vừa gác núi, trẻ chăn trâu thường tụ tập chốn này. Chúng chợt nghe có tiếng trẻ nhỏ khóc dưới núi bèn gọi nhau đến đó. Đến nơi, chúng thấy một hài nhi dáng vẻ khôi ngô nằm trên chỗ lõm của khối "Thạch Linh" khóc vang như tiếng chuông lớn. Bọn trẻ bèn lấy tay làm kiệu, lấy nón làm lọng, lấy khăn làm cờ bế bồng đón về. 

Bỗng nhiên gió mưa sấm chớp đùng đùng, cát bay, đá cuộn khắp nơi. Hài nhi hét lên một tiếng rồi bay thẳng lên trời. Trên không trung có tiếng vọng lại: "Ta là Phi Bồng Hiệu Thiên Đại tướng quân giáng hạ". Mọi người tụ tập nơi đó thấy khối Thiên Thạch bị mài mòn hơn một thước lấy làm kinh ngạc liền lập miếu phụng thờ. Từ đó, Đức Thánh anh linh hiển ứng, bảo hộ cho quốc phú, dân cường.

Đến Triều Trần, Thanh Phi Bồng Hiệu Thiên phù trợ giúp Hưng Đạo Đại Vương Trần Quốc Tuấn đánh giặc Nguyên Mông. Sau được nhà vua sắc phong Bách Thần Nguyên Tự Thần Hiệu "Phi Bồng Hiệu Thiên tối linh Thượng Thượng Đẳng Thần".

Năm 1994, đền Sinh, đền Hóa được công nhận là di tích lịch sử văn hóa và danh thắng Quốc gia, theo quyết định số 295/QĐ-BT ngày 12/2/1994.